FREEDOM
Frequency Domain Multichannel Deconvolution für die Markerdiskriminierung in digitalen Multiplex-Assays
Thema Photonik für Lebenswissenschaften
Fördermaßnahme Computer-Aided Photonics
Projektlaufzeit 01.02.2021 - 31.07.2024
Projektvolumen 2433721
Förderquote zu 66,7 % durch das BMFTR gefördert
Beschreibung
Motivation
Die individuellen Eigenschaften von Lebewesen sind im Erbgut oder der Erbinformation gespeichert. Mit der sogenannten Gensequenzierung können diese Informationen ausgelesen und analysiert werden.
Das Erbgut oder Genom eines jeden Lebewesens vom Menschen bis zum Einzeller ist einzigartig, und die Gensequenzierung ist das Werkzeug der Lebenswissenschaften, um dieses Genom zu lesen.
Mit dieser Methode lassen sich u.a. gentechnisch veränderte Lebensmittel aufspüren, Krankheitserreger identifizieren, Abstammungen und Verwandtschaftsverhältnisse bestimmen sowie erfolgreiche Krebstherapien entwickeln.
Ziele und Vorgehen
Ziel des Projekts ist es, ein Verfahren zur Analyse von Genmaterial effizienter und schneller zu machen.
Die sogenannte Digitale PCR (dPCR) ist das modernste Verfahren der Gentechnik, um in Probenmaterial Gensequenzen aufzufinden und deren Menge zu bestimmen. Dabei werden molekulare Sonden eingesetzt, die sich nur an fest vorgegebene Gensequenzen anlagern können. Lagern sich die Sonden an der Zielsequenzen, so ändern sie ihr Fluoreszenzverhalten. Diese Änderung kann optisch detektiert werden.
Durch eine innovative Auslesestrategie soll der Zustand mehrerer Sonden gleichzeitig erkannt und das Verfahren so parallelisiert werden.
Innovation und Perspektiven
Mit dem innovativen Analyseverfahren lassen sich die Fluoreszenzsignale parallel ohne teure optische Filter detektieren. Dadurch ist es möglich mit vergleichsweise kostengünstigen Bauteilen ein leistungsfähiges Analysegerät herzustellen.
Verlaufen die Arbeiten erfolgreich, wird das Vorhaben die technologische Basis für eine völlig neue Klasse von Analysegeräten für die schnelle Gensequenzierung bereitstellen.
Projektkoordination
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Hamilton Freiburg GmbH - Freiburg im Breisgau
Baden-Württemberg
Dr. Andreas Ernst
E-Mail: andreas.ernst@biofluidix.com
Projektpartner
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Hygiena Diagnostics GmbH - Potsdam
Brandenburg
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Cadida Software GmbH - Freiburg im Breisgau
Baden-Württemberg
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Hahn-Schickard-Gesellschaft für angewandte Forschung e.V. - Freiburg im Breisgau
Baden-Württemberg
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Stiftung für Lasertechnologien in der Medizin und Meßtechnik an der Universität Ulm - Ulm
Baden-Württemberg